Lo único que necesitamos para desinstalar Netbeans de Ubuntu es buscar el script encargado de esto. Obviamente esto es para aquellos que como yo instalamos Netbeans descargandolo desde http://netbeans.org/ para Linux. El script para eliminar el netbeans se encuentra en la carpeta raíz del netbeans, que por lo general se encuentra en el home.
Al ejecutar el script aparecerá una pantalla similar a la siguiente la cual te pregunta si deseas conservar las instancias de servidor que tengas instaladas y la carpeta de configuración del netbeans.
Happy coding!